MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 22969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017440	GCC	2	6	4	9	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017440	TGC	2	6	63	68	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017440	ATT	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017440	CGA	2	6	97	102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017440	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017440	TAT	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017440	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017440	GAA	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017440	AGA	2	6	315	320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017440	AGA	2	6	369	374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017440	CAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017440	AATG	2	8	466	473	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017440	TTG	2	6	585	590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017440	CTC	2	6	614	619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017440	GAT	2	6	676	681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017440	GAT	2	6	730	735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017440	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017440	ATG	2	6	793	798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017440	CTAT	2	8	800	807	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017440	CCT	2	6	952	957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017440	CTT	2	6	1013	1018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017440	CAG	2	6	1078	1083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017440	TGA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017440	A	6	6	1203	1208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017440	AAG	2	6	1220	1225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017440	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017440	CTT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017440	T	7	7	1247	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017440	A	6	6	1258	1263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017440	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017440	ATG	2	6	1336	1341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245897
32	NC_017440	GTG	2	6	1342	1347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245897
33	NC_017440	TCC	2	6	1351	1356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245897
34	NC_017440	AGC	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245897
35	NC_017440	T	6	6	1384	1389	0 %	100 %	0 %	0 %	385245897
36	NC_017440	AGC	2	6	1392	1397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245897
37	NC_017440	AAG	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245897
38	NC_017440	TAC	2	6	1441	1446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245897
39	NC_017440	GCT	2	6	1451	1456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245897
40	NC_017440	AGTA	2	8	1489	1496	50 %	25 %	25 %	0 %	385245897
41	NC_017440	AAC	2	6	1549	1554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245897
42	NC_017440	AGA	2	6	1561	1566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245897
43	NC_017440	T	6	6	1639	1644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017440	TAA	2	6	1651	1656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017440	T	7	7	1661	1667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017440	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017440	A	6	6	1733	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017440	AGA	2	6	1817	1822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245898
49	NC_017440	ATC	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245898
50	NC_017440	TGC	2	6	1844	1849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245898
51	NC_017440	ATGA	2	8	1893	1900	50 %	25 %	25 %	0 %	385245898
52	NC_017440	GATA	2	8	1931	1938	50 %	25 %	25 %	0 %	385245898
53	NC_017440	CAT	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245898
54	NC_017440	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245898
55	NC_017440	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245898
56	NC_017440	GGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245898
57	NC_017440	AG	3	6	2153	2158	50 %	0 %	50 %	0 %	385245899
58	NC_017440	ATC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245899
59	NC_017440	TTTC	2	8	2228	2235	0 %	75 %	0 %	25 %	385245899
60	NC_017440	ATA	2	6	2340	2345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245899
61	NC_017440	AAC	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385245899
62	NC_017440	GGT	2	6	2419	2424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245899
63	NC_017440	AAT	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245899
64	NC_017440	TTC	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245899
65	NC_017440	GCA	2	6	2579	2584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245899
66	NC_017440	GGA	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245899
67	NC_017440	CAG	2	6	2646	2651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245899
68	NC_017440	GTT	2	6	2663	2668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245899
69	NC_017440	GGT	2	6	2755	2760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245899
70	NC_017440	GA	3	6	2821	2826	50 %	0 %	50 %	0 %	385245899
71	NC_017440	T	6	6	2828	2833	0 %	100 %	0 %	0 %	385245899
72	NC_017440	AAG	2	6	2913	2918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245899
73	NC_017440	ATT	2	6	2975	2980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245899
74	NC_017440	TTG	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245899
75	NC_017440	CATG	2	8	3109	3116	25 %	25 %	25 %	25 %	385245899
76	NC_017440	AAG	2	6	3138	3143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245899
77	NC_017440	AAG	2	6	3153	3158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245899
78	NC_017440	CAG	2	6	3195	3200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245899
79	NC_017440	GCT	2	6	3266	3271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245899
80	NC_017440	TGTGA	2	10	3281	3290	20 %	40 %	40 %	0 %	385245899
81	NC_017440	TTCC	2	8	3414	3421	0 %	50 %	0 %	50 %	385245899
82	NC_017440	AAG	2	6	3432	3437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245899
83	NC_017440	CAG	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245899
84	NC_017440	GGA	2	6	3569	3574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245899
85	NC_017440	AAT	2	6	3579	3584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245899
86	NC_017440	TTGAA	2	10	3637	3646	40 %	40 %	20 %	0 %	385245900
87	NC_017440	ATT	2	6	3659	3664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245900
88	NC_017440	TGA	2	6	3689	3694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245900
89	NC_017440	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	385245900
90	NC_017440	GTA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245900
91	NC_017440	GAGAA	2	10	3931	3940	60 %	0 %	40 %	0 %	385245900
92	NC_017440	AGA	2	6	3968	3973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245900
93	NC_017440	ATCC	2	8	4112	4119	25 %	25 %	0 %	50 %	385245900
94	NC_017440	GAA	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245900
95	NC_017440	CGT	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245900
96	NC_017440	A	7	7	4328	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	385245900
97	NC_017440	GTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245900
98	NC_017440	GAAAA	2	10	4368	4377	80 %	0 %	20 %	0 %	385245900
99	NC_017440	A	7	7	4374	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	385245900
100	NC_017440	TGA	2	6	4472	4477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245900
101	NC_017440	AT	3	6	4514	4519	50 %	50 %	0 %	0 %	385245900
102	NC_017440	TTACA	2	10	4523	4532	40 %	40 %	0 %	20 %	385245900
103	NC_017440	TTG	2	6	4567	4572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245900
104	NC_017440	TTC	2	6	4708	4713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245900
105	NC_017440	TCT	2	6	4800	4805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245900
106	NC_017440	AGA	2	6	4820	4825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245900
107	NC_017440	GTT	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385245900
108	NC_017440	GACG	2	8	4859	4866	25 %	0 %	50 %	25 %	385245900
109	NC_017440	GGT	2	6	4895	4900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245900
110	NC_017440	AAAGCT	2	12	4941	4952	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385245900
111	NC_017440	TTGG	2	8	4962	4969	0 %	50 %	50 %	0 %	385245900
112	NC_017440	CTC	2	6	4999	5004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385245900
113	NC_017440	AGC	2	6	5030	5035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245900
114	NC_017440	GCA	2	6	5055	5060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017440	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017440	AGA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017440	ATT	2	6	5149	5154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385245901
118	NC_017440	TCT	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245901
119	NC_017440	GCT	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245901
120	NC_017440	GTCTT	2	10	5219	5228	0 %	60 %	20 %	20 %	385245901
121	NC_017440	GAT	2	6	5248	5253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385245901
122	NC_017440	TC	3	6	5264	5269	0 %	50 %	0 %	50 %	385245901
123	NC_017440	GA	3	6	5275	5280	50 %	0 %	50 %	0 %	385245901
124	NC_017440	ACG	2	6	5286	5291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385245901
125	NC_017440	GAA	2	6	5310	5315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245901
126	NC_017440	TGGA	2	8	5323	5330	25 %	25 %	50 %	0 %	385245901
127	NC_017440	AT	3	6	5379	5384	50 %	50 %	0 %	0 %	385245901
128	NC_017440	AGA	3	9	5387	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245901
129	NC_017440	GCT	2	6	5396	5401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385245901
130	NC_017440	AGA	2	6	5405	5410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245901
131	NC_017440	TGG	2	6	5441	5446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385245901
132	NC_017440	AGA	3	9	5459	5467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245901
133	NC_017440	GGA	2	6	5468	5473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245901
134	NC_017440	TG	3	6	5532	5537	0 %	50 %	50 %	0 %	385245901
135	NC_017440	T	6	6	5610	5615	0 %	100 %	0 %	0 %	385245901
136	NC_017440	TCA	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385245901
137	NC_017440	GGA	2	6	5690	5695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385245901
138	NC_017440	CTTT	2	8	5700	5707	0 %	75 %	0 %	25 %	385245901
139	NC_017440	CTT	2	6	5750	5755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385245901
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407	NC_017440	GA	3	6	18665	18670	50 %	0 %	50 %	0 %	385245913
408	NC_017440	GA	3	6	18764	18769	50 %	0 %	50 %	0 %	385245913
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432	NC_017440	AAT	2	6	19795	19800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245913
433	NC_017440	AAG	2	6	19838	19843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385245913
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435	NC_017440	T	6	6	19899	19904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
436	NC_017440	T	6	6	19906	19911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
437	NC_017440	TAA	2	6	19934	19939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385245914
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453	NC_017440	A	6	6	20554	20559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017440	CCT	2	6	20565	20570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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457	NC_017440	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_017440	AT	3	6	22511	22516	50 %	50 %	0 %	0 %	385245916
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